遠東關係企業創辦人徐有庠先生，與其介弟故徐渭源先生，鑑於新北市位居交通要衝及工商業重鎮，卻缺乏設備完善較具規模之醫院可為地方服務，每有重大傷患或急症病人，均須轉送台北巿，因路途遙遠，延誤就醫之憾事時有所聞，為減輕民眾看病之不便，並有效減少病患送醫途中的死亡率，徐創辦人秉持「取之社會，用諸社會」之旨，實踐「己立立人」的庭訓，並貫徹企業回饋鄉里的理念，以徐元智先生之名，先捐款成立徐元智先生紀念基金會，後於1971年3月再發起創設徐元智先生醫藥基金會。基金會設立，以自建醫院救助貧病以及獎勵醫藥發展為宗旨，並以服務人群，貢獻國家社會為目的，故名為亞東紀念醫院(FAR EASTERN MEMORIAL HOSPITAL)。

本院於 1981 年 4 月 1 日正式開幕啟用，先後於 1983 年度經教育部評鑑為準二級教學醫院，1985 年獲評為二級教學醫院，1988 年度評為區域醫院，由於病患急速增加， 為提供就醫患者更良好的醫療環境，乃於 1989 年計畫擴建，1991 到 1997 年度經評鑑為區域醫院及教學醫院。

1999 年主管營確立邁向醫學中心之願景，2000 到 2003 年更獲評為區域醫院暨乙類教學醫院，2006 年順利通過衛生署評定成為新北市第一家醫學中心，同年 5 月 31 日捷運板南線亞東醫院站通車，供新北市醫療資源匱乏地區，如板橋、新莊、中和、土城、樹林等地區，更便利優質之醫療選擇，並成為新北市重要之急重症醫療機構，亞東紀念醫院從此邁入新紀元。2009 年再度通過新制醫學中心評鑑，同年在基金會的支持下開始第二次擴建，充分落實醫院設立之宗旨：「持續提升醫療品質，善盡社會醫療責任」， 並深獲社會大眾之肯定，向世界級醫學中心邁進。